Η Β΄ Ορθοπαιδική Πανεπιστημιακή Κλινική ιδρύθηκε με το Π.Δ.25/92 “Ίδρυση κλινικών στο Τμήμα τής Ιατρικής τού Πανεπιστημίου Αθηνών” (ΦΕΚ 550Β/94) και άρχισε να νοσηλεύει ασθενείς το 1998, λόγω εργασιών αναμορφώσεως τού χώρου εγκατάστασης της στο Κωνσταντοπούλειο Συγκρότημα. Από το ακαδημαϊκό έτος 2000-2001 άρχισε και η εκπαίδευση φοιτητών, σε αριθμό ανάλογο (οι 16-18 τελευταίοι τής κάθε σειράς τής Α΄ Ορθοπαιδικής Κλινικής) με την δύναμη τού υπηρετούντος ΔΕΠ, και των αναπτυγμένων κλινών.